Jean Trujillo a commencé sa carrière en tant qu'illustrateur à partir des années 1980. Il a réalisé des couvertures pour des livres et des magazines, ainsi que des affiches promotionnelles. Son style est caractérisé par une grande maîtrise de la ligne et une palette de couleurs vive et colorée.
En 1993, il a créé sa première bande dessinée intitulée "Roujin". La série a été publiée dans le journal français "Metal Hurlant" et a reçu un grand succès auprès du public. Les histoires de Jean Trujillo sont généralement basées sur des thèmes d'horreur et de science-fiction, mais il a également travaillé sur des bandes dessinées plus légères telles que "Boum !", une adaptation en bande dessinée du film homonyme réalisé par Jan Kounen.
En 2010, Jean Trujillo a fait ses débuts au cinéma en tant que réalisateur avec le film d'horreur "Le Rideau". Le film a reçu des critiques mitigées mais a connu un certain succès commercial. Depuis lors, il a réalisé plusieurs autres films tels que "La Nuit du chasseur" (2013) et "L'Ennemi intérieur" (2017).
Jean Trujillo est également connu pour son travail de dessinateur sur la série télévisée d'animation "Le Monde de Neblina". La série, créée par le studio japonais Sunrise, a été diffusée entre 1985 et 1987 en France. Jean Trujillo a réalisé les dessins des personnages ainsi que la conception visuelle générale de l'univers de Neblina.
En 2016, Jean Trujillo a été distingué avec le Prix Saint-Michel du meilleur album pour "Cannabisland", une bande dessinée satirique sur les effets psychédéliques de la consommation de cannabis.
Aujourd'hui, Jean Trujillo continue à travailler dans le monde de l'illustration et de la bande dessinée, et est considéré comme l'un des artistes français les plus talentueux de sa génération.