En 1993, il a rejoint la société de production Prodis et a été engagé sur plusieurs projets télévisés pour Radio-Canada. Deux ans plus tard, il a co-créé la série *Virginie*, qui a rencontré un grand succès populaire et critique.
En 1998, il a quitté Prodis pour fonder sa propre société de production, Quark Films. Son premier projet avec cette nouvelle structure a été le film *Le Collectionneur*, sorti en salles en 2000. Le film a remporté plusieurs prix au Festival international du cinéma francophone d'Angoulême et a été nommé pour un Prix Jutra dans plusieurs catégories.
En 2001, il a créé la série *Le Clan*, qui a rencontré également un grand succès populaire et critique. La série a été diffusée sur le réseau de télévision Radio-Canada pendant cinq saisons.
En 2005, il a créé la série *Dans une galaxie près de chez vous*, qui est une adaptation de la bande dessinée québécoise *La Guerre des étoiles*. La série a été diffusée sur le réseau Ici Radio-Canada Télé et a remporté plusieurs prix, dont le Prix Gémeaux pour la meilleure série dramatique.
En 2018, il a créé la série *Médici*, qui est une adaptation de l'histoire de la famille Médicis. La série a été diffusée sur Netflix et a remporté plusieurs prix, dont un Emmy Award pour la meilleure photographie à la télévision.
En 2020, il a créé la série *L'Heure de Gilles Villeneuve*, qui est une adaptation du livre *Gilles Villeneuve* écrit par Yves Gauthier. La série a été diffusée sur le réseau Ici Radio-Canada Télé et a remporté plusieurs prix, dont le Prix Gémeaux pour la meilleure réalisation de fiction dramatique.
En 2021, il a créé la série *Le Détour du Détroit*, qui est une adaptation du roman éponyme de Denise Chong. La série a été diffusée sur le réseau Ici Radio-Canada Télé et a remporté plusieurs prix, dont le Prix Gémeaux pour la meilleure réalisation de fiction dramatique.
Philippe Chabot est considéré comme l'un des réalisateurs les plus importants du cinéma et de la télévision québécois. Il a remporté plusieurs prix, dont le Prix Jutra pour la meilleure réalisation et le Prix Gémeaux pour la meilleure réalisation de fiction dramatique.