En 2001, il a réalisé son premier long-métrage, "Les Enfants du marais", qui a été un grand succès critique et commercial. Le film, racontant l'histoire d'amour entre deux adolescentes qui vivent dans une communauté de gens transgenres au Marais, en Paris, a été acclamé pour son approche sensible et révolutionnaire sur les questions de genre et de sexualité.
En 2004, Maury a réalisé "Un long dimanche de fiançailles", un film adapté du roman éponyme de Sébastien Japrisot. Le film a été sélectionné à la Mostra de Venise et a été acclamé par la critique pour sa mise en scène élégante et son approche sensuelle des relations entre les personnages.
En 2014, Maury a réalisé "Le Dernier Coup de Marquis", une comédie dramatique qui raconte l'histoire d'un escroc de grand chemin qui se retrouve obligé de rentrer dans le monde du crime organisé pour protéger sa fille. Le film a été acclamé par la critique pour sa mise en scène brillante et son approche réfléchie des questions de paternité et de responsabilité parentale.
En 2018, Maury a réalisé "L'Amant double", un thriller psychologique qui raconte l'histoire d'une femme qui se retrouve confrontée à son ex-mari qui semble avoir une schizophrénie multiple personnalité. Le film a été acclamé par la critique pour sa mise en scène maîtrisée et son approche sombre et complexe des questions de psychologie humaine.
Philippe Maury est considéré comme l'un des meilleurs réalisateurs français contemporains, grâce à ses films sensibles, artistiques et réfléchis qui abordent des sujets complexes tels que la sexualité, la transition de genre et les relations humaines. Ses films sont toujours attendus par les critiques et les fans de cinéma.