Elle a commencé sa carrière en jouant des rôles secondaires dans plusieurs séries télévisées françaises, notamment *Plus belle la vie* et *Scènes de ménages*. Sa première grande apparition sur scène fut au Théâtre national de la Colline, où elle incarna le rôle-titre de *Miss Julie*, mis en scène par Joël Pommerat.
En 2016, Maria Isbert a obtenu un rôle principal dans la série télévisée *Marseille* créée par Robert Harris, aux côtés d'acteurs comme Gerard Depardieu et Benoît Magimel. Elle incarne le personnage de Julie de Marseille, fille du maire, qui tente de gagner du terrain dans le monde politique marseillais. La série a été diffusée sur Canal+ et Netflix.
En 2017, Maria Isbert a joué un rôle secondaire dans la comédie romantique *Le Sens de la fête*, réalisée par Cédric Klapisch et au côté d'acteurs comme François Cluzet et Laurent Lafitte. Elle interprète le personnage de Manon, une jeune femme qui tombe amoureuse de son voisin, un violoncelliste.
En 2018, Maria Isbert a joué dans la série télévisée *Le Sphinx*, diffusée sur France 2, aux côtés de Laurent Maurel et Thierry Frémont. Elle y interprète le personnage d'Eve, une jeune femme qui enquête sur les mystères entourant la disparition d'un écrivain célèbre.
En 2019, elle a joué dans le téléfilm *Le Roi des dames*, réalisé par Josée Dayan et adapté de l'œuvre du même nom de Dominique Manotti. Elle y interprète le personnage principal, une jeune femme qui se met en tête de devenir championne de boxe.
Maria Isbert est également connue pour ses participations à des pièces de théâtre, notamment *L'Aigle aux dents blanches* au Théâtre national de la Colline et *Dans la solitude après le bonheur* au Théâtre national populaire. Elle a reçu plusieurs distinctions pour sa carrière, notamment le Molière du jeune espoir féminin en 2014.