Il a passé une grande partie de sa jeunesse et de son adolescence en région parisienne, où il a fait ses études primaires et secondaires. En 1974, il s'inscrit à la Faculté des lettres de l'Université Paris-Sorbonne pour poursuivre des études supérieures d'histoire.
Après avoir obtenu son diplôme en 1978, il entame une carrière universitaire et académique. En 1982, il devient chargé de cours à l'Université Paris-Sorbonne et obtient un poste d'assistant de recherche au Centre national de la recherche scientifique (CNRS) en 1984. Il réussit son habilitation à diriger des recherches en 1990, puis est nommé maître de conférences en 1992.
En parallèle, il poursuit une carrière d'écrivain et publie plusieurs ouvrages consacrés à l'histoire moderne et contemporaine. Ses travaux ont trait à des sujets tels que la France au XVIIIe siècle, le régime de Vichy, les relations internationales pendant la Seconde Guerre mondiale et la décolonisation.
En 1996, il est nommé professeur agrégé puis, en 2005, professeur titulaire à l'Université Paris-Sorbonne. Il occupe également plusieurs postes de direction dans des institutions académiques et culturelles françaises, notamment au Collège de France, à l'Institut national de recherche pédagogique (INRP) et à l'Institut national de recherche historique (INRH).
En 2017, il est élu membre de l'Académie française. Il a reçu plusieurs récompenses et distinctions pour ses travaux, notamment le Prix Broquette-Gonin en 1985 et le Grand prix Gobert en 1994.
Aujourd'hui, Louis Pierre Henriquel Dupont est considéré comme l'un des historiens les plus influents de la France contemporaine. Sa carrière a connu une expansion internationale grâce à ses nombreux ouvrages traduits en plusieurs langues et à ses collaborations avec d'autres chercheurs et institutions étrangères.