Après des études à l'Institut des hautes études cinématographiques (IDHEC), Philippe Labordé-Rayna a commencé sa carrière dans le cinéma en tant qu'assistant réalisateur. Il a travaillé sur de nombreux films et téléfilms avant de se lancer dans la réalisation de courts métrages et de documentaires.
En 1998, il réalise son premier long métrage, "Le Chien", qui est sélectionné au Festival de Cannes. Cette adaptation d'un roman de Michel Vinaver obtient également le Grand Prix du Jury au Festival International du Film Francophone de Namur.
En 2001, il réalise son deuxième long métrage, "Le Baiser mortel de Madame V. au claire de lune", qui est également sélectionné au Festival de Cannes. Ce film est récompensé du Prix Louis-Delluc et du César du meilleur scénario original.
Depuis, Philippe Labordé-Rayna a réalisé plusieurs autres longs métrages, notamment "Le Grand Voyage" (2004), "Une vie sans fin" (2006) et "Mademoiselle Chambon" (2009). En 2018, il réalise son dernier film à ce jour, "Jeune femme et l'Ours".
Philippe Labordé-Rayna a également travaillé comme réalisateur de télévision, notamment sur des émissions telles que "Renseignements généraux" (1993) et "Tropiques nocturnes" (2017).
En plus de son travail en tant que réalisateur, Philippe Labordé-Rayna est connu pour sa collaboration avec le scénariste Olivier Gorce. Ils ont écrit ensemble plusieurs films, notamment "Le Baiser mortel de Madame V. au claire de lune" et "Mademoiselle Chambon".
Philippe Labordé-Rayna est également reconnu pour son style de réalisation marqué par une sensibilité à la fois lyrique et psychologique, ainsi que par sa prédilection pour des sujets abordés avec une certaine subtilité et une grande finesse.