Stanton a obtenu un diplôme en ingénierie électrique à l'université Cornell en 1982. Il a ensuite rejoint le Massachusetts Institute of Technology (MIT), où il a travaillé pendant près de vingt ans dans différents laboratoires, dont celui d'informatique et de technologie de l'information (CSAIL). Pendant ce temps, il a également été professeur associé à la faculté du MIT.
Stanton est surtout connu pour son travail dans le domaine des réseaux de télécommunication sans fil. Il a notamment travaillé sur la technologie Wi-Fi et a joué un rôle important dans le développement de cette technique au début des années 1990. En plus de Wi-Fi, Stanton a également contribué à la conception de technologies telles que Bluetooth et Zigbee.
En 2003, Stanton a cofondé AirSpan Networks Inc., une entreprise spécialisée dans les solutions de télécommunication sans fil pour des applications industrielles et militaires. En 2018, il a rejoint la société Qualcomm Inc. en tant que vice-président senior pour l'innovation en technologie de réseau privé.
En plus de sa carrière professionnelle, Stanton est également un écrivain actif dans le domaine des technologies de l'information et de la communication (TIC). Il a publié plusieurs articles scientifiques ainsi que deux livres, intitulés "Wireless Communications: Principles and Practice" (1992) et "Micro MIMO: Millimeter-Wave Massive Multiple Input Multiple Output Systems" (2018).
John Stanton est reconnu pour ses nombreuses contributions au domaine des réseaux informatiques et internet. Il a reçu plusieurs distinctions en reconnaissance de son travail, dont le prix IEEE Communications Society Leonard G. Abraham Prize en 2006, le prix IEEE Communications Society Ad Hoc Networks Technical Committee (ANTC) Award en 2007 et le prix IEEE Joseph S. Loftis Memorial Award en 2015.