John Denison Baldwin (né le 6 mai 1948) est un scientifique américain, spécialisé en physiologie cellulaire et en génétique moléculaire.
Baldwin a grandi à San Diego, en Californie, où il a terminé ses études secondaires au Point Loma High School. Il a ensuite obtenu son diplôme de bachelier du Massachusetts Institute of Technology (MIT) en 1970 et son doctorat de l'université de Californie à San Francisco en 1974.
En 1978, Baldwin rejoint le département de physiologie à l'université Yale, où il a travaillé pendant plusieurs années. Il est ensuite retourné à l'UC San Francisco pour y occuper un poste de professeur.
Baldwin est connu pour son travail sur la régulation génétique des processus de croissance cellulaire et de différenciation cellulaire dans les cystes d'ouefs de Drosophila (une petite mouche). Il a découvert que certaines protéines, appelées Bicoid et Hunchback, jouent un rôle crucial dans la régulation génétique de la croissance et de la différenciation des cellules.
En 1989, Baldwin a été nommé professeur de biologie moléculaire au MIT. Depuis lors, il a continué à travailler sur les mécanismes de régulation génétique dans les cystes d'ouefs de Drosophila et à déterminer comment ces mécanismes peuvent être mis à l'œuvre pour traiter certains types de cancer.
Baldwin a reçu plusieurs récompenses pour son travail, y compris le prix Dickson d'électrophysiologie en 1986 et le prix Gairdner International Award en 2000. Il est également membre de l'Académie nationale des sciences des États-Unis depuis 1994.
Aujourd'hui, Baldwin continue à travailler à l'université Yale en tant que professeur émérite de biologie moléculaire et cellulaire.