Après avoir étudié au Centre Collège de Lexington, John Breckinridge alla à l'Université Transylvanie, où il étudia le droit et reçut son diplôme en 1840. Il entama alors sa carrière politique en servant comme procureur général de l'État du Kentucky de 1845 à 1849. Il fut ensuite élu au Sénat des États-Unis, où il représenta le Kentucky jusqu'en 1857.
En 1856, Breckinridge fut le candidat démocrate pour l'élection présidentielle de cette année-là . Toutefois, son rival, John C. Frémont, du Parti républicain, eut plus de succès et fut élu à sa place.
En 1860, Breckinridge fut de nouveau le candidat démocrate pour l'élection présidentielle. Il s'opposa à la décision des États-Unis d'esclavagisme dans les territoires nouvellement acquis en raison de son soutien à l'extension de l'esclavage aux nouveaux États. Sa campagne électorale reçut le soutien des esclavagistes méridionaux, qui voulaient empêcher la réélection du président Abraham Lincoln, un opposant à l'esclavage. Bien que Breckinridge perdit l'élection face à Lincoln, son nombre élevé de voix dans les États méridionaux contribua au déclenchement de la Guerre de Sécession.
En 1861, après le début de la guerre, Breckinridge fut nommé secrétaire à la Guerre par le président James Buchanan. Il quitta ce poste en 1862 pour revenir au Kentucky, où il s'engagea dans l'armée confédérée comme général de brigade. Après la guerre, Breckinridge fut impliqué dans des affaires immobilières à Louisville et mourut le 17 mai 1875 à Cincinnati.
John Breckinridge est un exemple de l'importance de la question de l'esclavage sur la scène politique américaine dans les années précédant la Guerre de Sécession. Son opposition au président Lincoln et son soutien à l'extension de l'esclavage eurent une influence significative sur la décision des États méridionaux d'abandonner l'Union en 1861.