Formé au Collège de Genève, Pierre Choz Amiet s'orienta vers la carrière artistique et commença à étudier à l'Académie des beaux-arts de Genève sous la direction d'Alexandre Calame, un peintre paysagiste suisse. Puis il continua sa formation à Paris, où il se spécialisa dans la gravure sur bois et la gravure à l'eau-forte.
Au début de sa carrière, Pierre Choz Amiet s'orienta vers la peinture d'histoire et des scènes de genre, mais c'est grâce aux nombreux voyages qu'il effectua au cours de sa vie que son style se définira. Il voyagea en Afrique, en Italie, au Portugal, en Espagne, en Amérique du Sud et en Polynésie française, où il fut influencé par la nature tropicale et les espèces marines et aviaires exotiques qu'il y découvrit.
Pierre Choz Amiet est surtout connu pour ses œuvres représentant des oiseaux et des poissons, notamment son tableau "Le Mouette" qui fut exposé au Salon de Paris en 1879. Sa maîtrise technique, sa précision dans la reproduction des détails de ces espèces animales et son sens du mouvement furent appréciés par ses contemporains et lui valurent d'être considéré comme un des peintres les plus talentueux de son époque.
Au fil des ans, Pierre Choz Amiet devint une figure importante de la vie artistique française. Il fut membre fondateur de la Société des aquafortistes, une société professionnelle consacrée à la gravure sur bois, et il enseigna la peinture à l'Académie Julian à Paris. Il fit également partie du jury du Salon de Paris et exposa régulièrement à Londres, Amsterdam, Bruxelles, Vienne, Dresde, Munich et Saint-Pétersbourg.
Malgré son succès en tant qu'artiste, Pierre Choz Amiet garda une grande modestie et un grand respect pour la nature. Il disait lui-même : "Le but de l'art n'est pas de reproduire ce qui est déjà beau mais de trouver dans le tracé des formes, les couleurs ou les sons, quelque chose de nouveau et de vivant".
Pierre Choz Amiet laisse une œuvre considérable, avec plus de 2000 dessins et gravures ainsi que plusieurs centaines de peintures. Aujourd'hui, ses œuvres sont exposées dans les plus grands musées du monde, notamment au Musée des beaux-arts de Boston, au Musée d'Orsay à Paris, au Metropolitan Museum of Art à New York et au Musée national suisse à Zurich.