Après des études à l'Université de Californie à Berkeley, Christopher Munch a travaillé comme assistant réalisateur pour Robert Altman (*Nashville*, 1975) puis Steven Spielberg (*La Guerre du jeu*, 1984). En 1986, il réalise son premier long-métrage, *Les Années de feu* (*The Hours and Times*), une fiction qui narre une rencontre imaginaire entre John Lennon et Brian Epstein. Le film est présenté en sélection officielle au Festival de Cannes la même année.
En 1992, il réalise son deuxième long-métrage, *L'Élève* (*The Color of a Man*), qui raconte l'histoire d'un homme noir éduqué qui tente de trouver sa place dans une société blanche. Le film remporte le prix du jury au Festival international du film de San Francisco.
En 1996, Christopher Munch réalise *Les Amants criminels* (*The Net*), un thriller cyber-phobique précurseur, qui est salué par la critique et a connu une certaine notoriété en raison des sujets traités (cybercriminalité et identité numérique).
En 2014, il sort son dernier film à ce jour, *Les Fils de l'ours* (*The Finishers*), un drame qui raconte l'histoire de deux frères qui tentent de réparer leur relation après des années de dispute. Le film a été présenté en sélection officielle au Festival international du film de Toronto.
Christopher Munch est également connu pour son travail en tant que producteur exécutif de la série télévisée *Masters of Sex* (2013-2016), créée par Michelle Ashford.
Au cours de sa carrière, Christopher Munch a reçu plusieurs distinctions et a été nommé à de nombreuses occasions, notamment au Festival du film de Sundance, au Festival international du film de San Francisco, au Festival international du film de Toronto, ainsi qu'au Gotham Awards.