Elle a commencé sa carrière de mannequin en 2004 lorsqu'elle a remporté l'édition néerlandaise de l'élégance Elite Model Look, ce qui a permis à Charlotte d'être représentée par l'agence d'Elite Model Management. Elle a ensuite travaillé pour des marques prestigieuses telles que Chanel, Louis Vuitton et Calvin Klein.
En plus de sa carrière de mannequin, Charlotte Anne Bongaerts a également participé à divers projets philanthropiques. En 2015, elle a été nommée ambassadrice du programme de sensibilisation et d'éducation aux droits des femmes par le Conseil économique et social des Nations unies pour la région des Amériques (ECOSOC). Elle est également porte-parole pour l'organisation caritative néerlandaise Stichting De Morgenster.
En 2017, Charlotte Anne Bongaerts a été élue mannequin de l'année aux Dutch Fashion Awards, un prix qui reconnaît les contributions exceptionnelles apportées par le milieu de la mode néerlandais. Elle est également considérée comme une figure influencielle dans le monde de la mode et de la beauté, grâce à son statut de mannequin et sa présence en ligne sur les réseaux sociaux.
En 2018, elle a été choisie pour être l'une des mannequins représentatives du parfum Dior Addict, campagne photographique réalisée par Peter Lindbergh. Elle est également devenue l'égérie d'autres marques prestigieuses telles que Valentino, Givenchy et Yves Saint Laurent.
En 2021, elle a été nommée ambassadrice mondiale pour la lutte contre les violences envers les femmes et les filles par l'ONU Femmes.
Charlotte Anne Bongaerts est une icône de la mode néerlandaise, qui utilise son statut d'influence pour promouvoir des valeurs positives et s'impliquer dans divers projets philanthropiques.