Blanquefort a grandi dans une famille modeste en Catalogne du Sud. À l'âge de 20 ans, il s'installe à Paris où il travaille dans plusieurs métiers avant de se consacrer complètement à son art en 1954. Il expose pour la première fois en 1963 au Musée de l'Art Brut à Lausanne et c'est avec cette exposition qu'il s'impose définitivement dans le monde de l'art brut.
Son œuvre est caractérisée par une forte originalité, une grande spontanéité et une intense expressivité. Il travaille principalement avec les matériaux les plus simples : papier, carton, craie, encre et peinture acrylique. Les sujets de ses œuvres sont divers mais il y a souvent des références à la nature, aux animaux et aux figures humaines.
En plus d'être un artiste, Jean Blanquefort est également connu pour avoir participé activement au mouvement des artistes autodidactes. Il a fondé avec son épouse Yolande plusieurs associations visant à promouvoir l'art brut et à soutenir les artistes isolés. L'une de ces associations est le Centre international d'art brut à Saint-Rémy-de-Provence, créé en 1965 par Jean Dubuffet.
Jean Blanquefort a également été un grand voyageur. Il a voyagé dans de nombreux pays du monde et a rencontré de nombreux artistes autodidactes. Ces voyages ont beaucoup influencé son œuvre, qui est marquée par une grande richesse culturelle et une grande diversité stylistique.
Au fil des ans, Jean Blanquefort a été reconnu comme un artiste de premier plan dans le monde de l'art brut. Son travail a été exposé dans plusieurs musées et galeries en France et à l'étranger. Il a également reçu plusieurs distinctions et récompenses, notamment la médaille d'or de la ville de Paris en 1984.
Jean Blanquefort a continué à créer jusqu'à son décès en 2018 à l'âge de 88 ans. Son œuvre est aujourd'hui considérée comme une référence dans le monde de l'art brut et il est reconnu comme un des principaux représentants de ce mouvement artistique.