Après des études à l'Université des Philippines où il obtient un baccalauréat en beaux-arts en 1992, Bert Santos commence sa carrière artistique en 1993. Son travail est alors exposé dans plusieurs galeries de Manille et d'autres villes philippines.
En 2000, il remporte le prix du meilleur artiste dans la catégorie "Sculpture" au Prix d'Art Contemporain des Philippines. Depuis cette date, Bert Santos a exposé son travail dans de nombreuses villes et pays à travers le monde, y compris en Europe, en Amérique du Nord et en Asie.
Le travail de Bert Santos est caractérisé par l'utilisation d'un large éventail de matériaux et de techniques, de la peinture à l'huile aux sculptures en bronze, en passant par les installations multimédia. Ses thèmes principaux sont la nature, la spiritualité et la philosophie.
Bert Santos est également connu pour être un activiste de l'art contemporain philippin. Il a fondé plusieurs organisations artistiques et a été membre du Conseil consultatif sur le développement de l'art contemporain des Philippines. En outre, il a participé à de nombreux colloques et conférences sur les questions d'art et de culture philippines.
En 2015, Bert Santos est nommé professeur associé à l'École supérieure d'arts visuels de Manille, un des principaux établissements d'enseignement en art philippin. En 2017, il devient membre du Conseil national des arts philippins.
Bert Santos est également connu pour son engagement dans la protection de l'environnement et les causes sociales. Il a été membre de plusieurs organisations écologiques et a participé à de nombreuses campagnes de sensibilisation environnementale. En 2016, il a créé une fondation qui vise à protéger et à préserver la forêt primaire des Philippines.
Bert Santos est considéré comme l'un des artistes contemporains philippins les plus importants de sa génération. Ses œuvres sont exposées dans des collections privées et publiques à travers le monde, y compris au Musée d'art moderne de Manille, au Musée d'art asiatique de l'université de Chicago et à la Bibliothèque nationale des Philippines.